PCR管/板有多種顏色，如透明色、白色、黃色、藍色、紅色……普通的PCR過程中，管/板的顏色并不會影響PCR的結果，但是在qPCR中，管/板的顏色對于結果是有很大的影響的。

應用于qPCR的耗材，一般是白色或者磨砂的塑料耗材。qPCR在DNA擴增反應中，以熒光化學物質測每次PCR循環后產物總量，因此與透明塑料管/板相比，白色或磨砂的管/板在應對熒光時表現更為靈敏，并且結果更加準確。這是因為白色的耗材可以阻止熒光折射出管，達到熒光折射的最小化，將更多的熒光信號反射回檢測器，從而增加信噪比，表現為更高的靈敏度；另外，白色管壁也可阻止熒光信號被PCR儀的加熱模塊吸收或進一步反射，從而可以降低重復實驗中的誤差，提高準確性。除此之外，在進行qPCR時需使用超透明的管蓋或光學密封膜來密封PCR管/板，保證熒光不受干擾；還需要參考qPCR的耗材要求，選擇最合適的耗材，達到優的實驗效果。